Kompetentsikeskused on ühendused, mis põhinevad avaliku võimu esindajate, teadus- ja arendusasutuste ning ettevõtete vahelisel uuenduslikul koostööl. Nende peamiseks eesmärgiks on pakkuda tuge piirkondliku ettevõtluse arengule nii kvalifitseeritud spetsialistide, erinevate uuringute ja koolituste, aga ka füüsilise keskkonna näol. Kompetentsikeskuse kaasabil on tulevikus ettevõtetel võimalik kindlates valdkondades välja töötada uusi tooteid, teenuseid ja tootmismeetodeid ning edendada eksporti, samuti on kompetentsikeskused uue ettevõtluse tekke mootoriks. Eestis tegutseb hetkel üheksa riigi poolt finantseeritud kompetentsikeskust:

• Väikelaevaehituse kompetentsikeskus  SCC (Kuressaare, Saaremaa)

• Põlevkivi Kompetentsikeskus  (Kohtla-Järve, Ida-Virumaa)

• Tervisedenduse ja taastusravi kompetentsikeskus  (Haapsalu, Läänemaa)

• Teadmistepõhiste tervise- ja loodustoodete kompetentsikeskus PlantValor (Polli, Viljandimaa)

• Puidutöötlemise ja mööblitootmise kompetentsikeskus TSENTER (Väimela, Võrumaa)